Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis bacteremia: Emm types and clinical characteristics—a 4-year prospective study
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The incidence of Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis (SDSE) bacteremia is increasing worldwide, yet studies linking emm types to clinical data remain limited. This study aimed to investigate associations between emm types, clinical manifestations, and disease severity in patients with SDSE bacteremia. METHODS: We prospectively studied 159 SDSE bacteremia episodes in Pirkanmaa, Finland (November 2015 to November 2019). Severe disease was defined as intensive care unit treatment and/or death within 30 days of hospital admission. RESULTS: While emm type stG480 has remained the most common, stG62647 has increased over tenfold to become the second most prevalent. Emm type stC74a was associated with intensive care unit treatment (odds ratio [OR] 5.8 [95% confidence interval (CI) 1.3-26)]), severe disease (OR 5.2 [95% CI 1.4-19]), and predominance of male patients (OR 8.5 [95% CI 1.1-67]). Surgical interventions were linked to emm type stG62647 (OR 2.8 [95% CI 1.1-7.3]). Potential associations between emm type and clinical manifestations were observed: stG643 with endocarditis, stG62647 with foreign-body infections, stG2078 with abscesses, and stG485 with unknown focus. CONCLUSIONS: These results emphasize the importance of emm types in connection with disease severity and clinical manifestations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».