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Enregistrement W7117357398 · doi:10.1186/s40659-025-00655-w

Mitochondrial and lysosomal dysfunctions might be involved in the pathogenesis of the CACNA1A-related neurodevelopmental disorders according to in vitro studies

2025· article· en· W7117357398 sur OpenAlexaff
Miriam Kessi, Langui Pan, Baiyu Chen, Li Yang, Lifen Yang, Olumuyiwa A. Bamgbade, Guoli Wang, Fei Yin, Fang He

Notice bibliographique

RevueBiological Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Hunan Province
Mots-clésMitochondrionMitochondrial DNAmitochondrial fusionChinese hamster ovary cellMitochondrial diseaseMitophagyDNAJA3Adenosine triphosphateMutationPINK1

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: CACNA1A variants are associated with severe neurodevelopmental disorders (NDDs), but the underlying mechanisms remain unclear. Our goal was to investigate the molecular mechanisms through which these variants lead to intellectual disability (ID), autism spectrum disorder (ASD), epilepsy, and ataxia. METHODS: Clinical information was collected from six pediatric patients. Molecular experiments were performed on transfected human embryonic kidney and Chinese hamster ovary cells to study the effect of these variants on mitochondrial and lysosomal function. RT-qPCR, Western blot, apoptosis assay, mitochondrial and lysosomal tracker fluorescence intensity, and mitochondrial calcium concentration tests were performed. Additionally, we examined the levels of reactive oxygen species (ROS), adenosine triphosphate (ATP), and mitochondrial enzymes and copy numbers. RESULTS: We identified six variants that downregulated CACNA1A mRNA: p.D1644N, p.Y62C, p.G701R, p.R279C, p.R1664Q, and p.L1422Sfs*8. Five variants down-regulated Cav2.1 protein expression, whereas, the p.R279C variant up-regulated it. All variants led to dysfunctions in the autophagy-lysosomal system: p.D1644N, p.R279C, and p.G701R variants blocked the fusion of autophagosomes and lysosomes while p.Y62C, p.R1664Q, and p.L1422Sfs*8 variants displayed increased lysosomal expression. The p.Y62C, p.G701R, p.R279C, p.R1664Q, and p.L1422Sfs*8 variants exhibited defective autophagy. The p.Y62C and p.D1644N variants disrupted mitochondrial function by downregulating mitochondrial enzyme activities and ATP levels, as well as by upregulating mitochondrial copy numbers, calcium levels, and ROS levels. Furthermore, the p.Y62C variant increased mitochondrial expression, fusion, and fission. In contrast, the p.D1644N variant decreased mitochondrial expression, fusion, fission, and mitophagy. The p.G701R, p.R279C, and p.R1664Q variants also interrupted mitochondrial function. These variants down-regulated mitochondrial enzyme activities, fusion and fission, the mitophagy process, and ATP levels while up-regulating mitochondrial copy numbers and ROS levels. The p.L1422Sfs*8 variant increased the expression, fusion and fission of mitochondrial proteins, while decreasing mitochondrial calcium levels and the mitophagy process. The p.R279C variant increased mitochondrial expression and calcium levels while enhancing apoptosis. The p.G701R variant decreased mitochondrial expression and calcium levels while enhancing apoptosis. The p.R1664Q variant increased mitochondrial calcium levels and enhanced apoptosis without changing mitochondrial expression. CONCLUSIONS: CACNA1A variants may alter mitochondrial and lysosomal function, resulting in the development of NDDs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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