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Enregistrement W7117365170 · doi:10.1186/s12870-025-07972-y

Plant growth-promoting Bacillus strains modulate early soybean development via proteome remodeling

2025· article· en· W7117365170 sur OpenAlexaff
Haleema Tariq, Pierre Dutilleul, Jennifer Geddes-McAlister, Anja Geitmann, D. L. Smith

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of GuelphMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomeSecondary metabolismSurfactinAuxinBacillus (shape)Bacillus thuringiensisMetabolic pathwayProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant adaptation to environmental stress involves tightly regulated cellular, molecular, and biochemical responses. Among these, microbe-assisted strategies have gained attention, particularly the role of the plant microbiome (phytomicrobiome) in promoting growth and stress resilience. Soybean (Glycine max), a major agricultural crop, actively recruits beneficial microbes through root-secreted secondary metabolites, fostering symbiotic interactions with endophytic bacteria. However, the direct and indirect impacts of root-associated endophytes on plant development remain incompletely understood. In this study, we investigated three Bacillus strains (HT1, HT2, and HT3) isolated previously from the soybean root microbiome.16 S rRNA analysis indicates that HT1 and HT2 are closely related to the Bacillus velezensis and HT3 to the Bacillus thuringiensis lineage although more detailed analyses are warranted for genus identification. These strains were selected for their demonstrated plant growth-promoting and biocontrol activities. Bacillus-HT1 and HT2 significantly enhanced soybean seed germination, while Bacillus-HT3 promoted leaf area expansion significantly compared to the control, indicating strain-specific developmental effects. To elucidate the molecular basis of these effects, we conducted shotgun proteomic profiling of soybean leaves. Enrichment analysis revealed distinct functional signatures, with Bacillus HT1 and HT2 associated with pathways linked to cellular component organization, microtubule dynamics, and organelle function, and Bacillus-HT3 inducing broader enrichment of photosynthesis, chloroplast organization, and biosynthetic processes. These findings suggest that HT1 and HT2 promote early developmental transitions, while HT3 enhances vegetative growth through large-scale metabolic reprogramming. Notably, proteins such as anthranilate synthase and proteasome subunit alpha type were differentially abundant, pointing to the potential involvement of auxin biosynthesis and ubiquitin-proteasome-mediated regulation but, the actual roles of these pathways remain to be validated. These findings provide mechanistic insights into how specific Bacillus strains modulate soybean development at the molecular level and highlight their potential for use as bio-inoculants to enhance crop productivity and resilience under stress conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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