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Enregistrement W7117449342 · doi:10.1111/ppl.70729

Dissecting Vegetative Period Into Its Phenotypic and Genotypic Components Allows Environment‐Specific Breeding in Lentil ( <scp> <i>Lens culinaris</i> </scp> Medik)

2025· article· en· W7117449342 sur OpenAlexafffundabout
Salvador Osuna‐Caballero, Taryn Heidecker, James L. Weller, Kirstin E. Bett

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSaskatchewan Pulse GrowersGovernment of SaskatchewanWestern Grains Research FoundationUniversity of SaskatchewanGenome Canada
Mots-clésQuantitative trait locusGeneCultivarPhenotypeLocus (genetics)GenotypePlant geneticsCandidate geneGenetic linkageVegetative reproduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In legumes, flowering time is regulated by genes responsive to temperature and photoperiod, presenting challenges for high-latitude lentil producers who must adapt cultivars to short growing seasons and extended daylight hours. Therefore, prolonged vegetative periods are favored in those areas. To address this, we studied a recombinant inbred line (RIL) population, derived from a cross between the adapted cultivar CDC-Milestone and the non-adapted line ILL8006, to investigate phenology-related traits under long-day conditions in western Canada. Significant variation in days to emergence (DTE), days to flowering (DTF), and days to pod maturity (DTM) enabled analysis of the vegetative (VegP) and reproductive (RepP) periods within the population. We constructed a high-density genetic linkage map using molecular markers linked to genes in the Lcu.2RBY reference genome, identifying quantitative trait loci (QTLs) for those traits across four site-years in Saskatchewan. Differential expression analysis of known flowering time genes enhanced interpretation of the QTL results for flowering time. Three major DTE QTLs (qDTE2/3.II, qDTE2/3.III, and qDTE2/3.IV) on chromosome 2 explained 16%-28% phenotypic variability, depending on the environment, with in silico analysis identifying six curated genes as putative candidates within that region. A key DTF QTL (qDTF6.I) on chromosome 6 accounted for 23%-56% of phenotypic variability, harboring a homolog of the FLOWERING LOCUS T gene, whose role was explored alongside other candidate genes. Dissecting the vegetative period into DTE and DTF revealed distinct genetic controls for each trait, enabling breeders to combine early or late emergence and flowering to optimize adaptation and yield in diverse agroclimatic conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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