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Enregistrement W7117456447 · doi:10.1002/cpe.70496

Predictive Modelling of Tick Distribution: A Machine Learning Approach to <i>Ixodes ricinus</i> Abundance

2025· article· en· W7117456447 sur OpenAlexaff
Kruttika Jamalpuram, Mhd Saeed Sharif, Afrin Nanmi, Samantha Lansdell, Ahmed Ibrahim Alzahrani, Nasser Alalwan, Sally Cutler

Notice bibliographique

RevueConcurrency and Computation Practice and Experience · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRandom forestSupport vector machineHyperparameter optimizationHyperparameterSampling (signal processing)GridPipeline (software)Categorical variableFeature selectionFeature (linguistics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The resurgence of tick‐borne diseases necessitates predictive frameworks that integrate both high accuracy and ecological relevance. This study develops a comprehensive machine learning pipeline to forecast the occurrence of Ixodes ricinus , a principal tick vector in Europe, leveraging high‐dimensional climatic, environmental, and land‐use datasets. We assembled and cleaned regional occurrence datasets from the United Kingdom and wider European repositories, to create a harmonized database comprising over 27,000 verified occurance record. To represent local tick presence and reduce spatial bias, we transformed the point data into 20 km‐wide hexagonal grid cell duplicates. The framework that integrates hexagonal spatial binning, binary transformation, and spatially aware absence selection maintains a balanced 1:2 ratio to minimize sampling bias and spatial autocorrelation. Spatial interpretation was strengthened by adopting DBSCAN with geodesic (haversine) distance, which identifies density‐based clusters and noise points and avoids the Euclidean‐distance constraints inherent to K‐Means. Each observation was paired with dynamic environmental and land‐use variables, including monthly rainfall, NDVI, temperature, and annual land cover. Models were trained and evaluated using stratified fivefold cross‐validation and optimized through RandomizedSearchCV, ensuring efficient exploration of hyperparameter spaces. Comparative evaluation across Random Forest, CatBoost, Gradient Boosting, AdaBoost, and Support Vector Machine classifiers demonstrated high predictive accuracy, with Random Forest achieving an ROC–AUC of 0.941% and F1‐score of 0.882%. Incorporating spatial constraints and temporally aggregated features improved ecological realism and generalisation, addressing prior limitations in temporal dynamics and sampling bias. Feature importance analysis revealed NDVI, rainfall, and temperature as dominant predictors, aligning with ecological expectations. The study centres on tick occurrence, establishing a scalable and robust framework poised to support early warning systems and enable data‐driven surveillance of tick populations across Europe.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,669
Score d'incertitude au seuil0,453

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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