Distribution and characteristics of extended spectrum β‑lactamase-producing Escherichia coli in stages of integrated broiler production in Korea
Notice bibliographique
Résumé
Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli ( E. coli ) are a major public health concern owing to their multidrug resistance and potential for transmission through the food chain. The broiler industry is operated as a vertically integrated system; therefore, the ESBL-producing E. coli can easily disseminate across production stages. The objective of this study was to provide the distribution and characteristics of ESBL-producing E. coli in each production stage of three integrated broiler operations in Korea, from breeder hatcheries to commercial broiler farms. The prevalence of ESBL-producing E. coli isolates was significantly highest in commercial broiler hatcheries (36.8%–38.1%), followed by broiler breeder farms (15.4%–26.9%), commercial broiler farms (2.8%–18.2%), and breeder hatcheries (9.8%–12.8%) ( p < 0.05). Moreover, ESBL-producing E. coli isolates exhibited higher MIC 50 values ranging from 16 to >512 μg/mL against 3 rd - or 4 th -generation cephalosporins, higher multidrug resistance prevalence (94.6%–100%) and co-resistance to more antimicrobial classes than non-ESBL-producing E. coli isolates at all stages of broiler production. The most prevalent ESBL gene was bla CTX-M-55 (80.0%–100.0%) by production stages of integrated broiler operations ( p < 0.05), and class I integrons were detected in 25.5%-33.3% of isolates, but only 10 (6.2%) isolates harbored gene cassettes. Phylogenetic group B1 (59.4%–65.5%) was the most significantly prevalent, and combination of IncFIB and IncFII plasmids (46.4%–53.6%) were the most common replicon types across production stages ( p < 0.05). Moreover, a total of 136 (81.2%–90.0%) isolates showed transferability of ESBL genes, and most (91.9%–100.0%) of ESBL-producing E. coli isolates form biofilm. However, weak biofilm producers (54.5%–71.0%) were significantly prevalent than moderate or strong producers ( p < 0.05). These findings support that it is necessary to establish stringent strategies for the use of ceftiofur, 3 rd -generation cephalosporin, in broiler production in Korea, as demonstrated in Japan and Canada, where the prevalence of ESBL-producing E. coli decreased after the cessation of ceftiofur use in hatcheries.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».