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Enregistrement W7117582307 · doi:10.1242/bio.062432

Spatial heterogeneity of lactylation: insights into gene expression, metabolism, and lactate transport in human embryonic stem cells

2025· article· en· W7117582307 sur OpenAlexafffund
Alexandra M. Kozlov, Zuleika C. L. Leung, Rachel B. Wilson, Sukhdeep Bhangal, Karen Nygard, Andrew M. Powell, Nica M. Borradaile, Dean H. Betts, Robert C. Cumming

Notice bibliographique

RevueBiology Open · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWestern University
Mots-clésSOX2Induced pluripotent stem cellEmbryonic stem cellReprogrammingHistoneAcetylationRegenerative medicineStem cellPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Low reprogramming efficiency and high phenotypic variability hinder the regenerative medicine applications of human pluripotent stem cells. Understanding the mechanisms that regulate pluripotency is crucial to overcoming these challenges. This study investigated the relationship between lactylation, a newly identified regulator of gene expression, pluripotency, metabolism, and lactate transport in human embryonic stem cells (hESCs). Histone lactylation levels were significantly higher in hESCs than in differentiated cells. Further, exogenous lactate increased histone lactylation and acetylation levels and altered pluripotency gene expression, notably increasing KLF4, KLF5, GBX2, and DMNT3L in hESCs. Finally, naïve-like hESC colonies exhibited higher lactylation levels peripherally, coinciding with elevated peripheral SOX2 levels. Conversely, lactate transport and production protein levels were higher centrally. This study suggests that elevated histone lysine lactylation levels are a newly identified characteristic of human pluripotency. The spatial distribution findings are consistent with a positive relationship between histone lactylation and SOX2 expression in naïve-like hESCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,498

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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