Rhythmicity of TOR (Target of Rapamycin) Activity Supports Circadian Function in <i>Neurospora crassa</i>
Notice bibliographique
Résumé
Circadian (24 h) rhythmicity is a nearly-ubiquitous property of eukaryotic cells, and the mechanisms that generate this rhythmicity have been studied in a number of organisms for many years. However, there are still gaps in our understanding of the generation and regulation of rhythms. Although transcription/translation feedback loops (TTFLs) are said to be essential to generating rhythmicity in eukaryotes, there are many examples of rhythmicity seen in organisms without functioning TTFLs. Our lab previously found that two genes that function in the TOR (Target of Rapamycin) pathway, vta and gtr2 , are essential for non-TTFL rhythmicity in the fungus Neurospora crassa. These two mutants were also shown to dampen the output rhythm of spore-formation (conidiation) and the rhythm of the TTFL component protein FRQ, and dampen the amplitude of the underlying oscillator in strains with functioning TTFLs. Therefore, we are interested in the role of TOR in generating and/or sustaining rhythmicity in both the presence and absence of a functioning TTFL. Here we report the development and validation of an improved assay for TOR activity in Neurospora , and using this assay we demonstrate that TOR activity displays circadian rhythmicity in strains with functioning TTFLs. The period of TOR rhythmicity is affected by a long-period mutation in a TTFL component ( frq 7 ), and the TOR rhythm is dampened in the vta and gtr2 knockouts. The mean level of TOR activity (mesor) in the vta and gtr2 knockout mutants is within the range of the TOR rhythm in wild type, indicating that it is rhythmicity of TOR, not a constant level of activity, that is required to sustain output rhythmicity. These results establish Neurospora as a valuable model for investigating the role of TOR in circadian rhythmicity and implicate TOR activity as a rhythmic state variable of the circadian system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».