Evaluation of Choline Metabolic Genes in the Liver of the Dam as Candidates for Mediating Choline’s Efficacy in Mitigating Ethanol-Induced Cell Death in the Neural Tube: A Preliminary Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background/Objectives: Emerging evidence has suggested that choline is an effective treatment for at least some of the neurobehavioral deficits associated with Fetal Alcohol Spectrum Disorders (FASD). However, the mechanism of how choline works to ameliorate ethanol’s teratogenic effects, and whether it acts directly on the fetus or indirectly by altering the uterine environment, remains unknown. Previous work from our lab demonstrated that 4 BXD mouse strains that show high levels of ethanol-induced cell death on embryonic day 9.5 (E9.5) have differential responses to choline supplementation. This differential response in mouse strains highlights a need to further understand the role of genetics in choline metabolism. Because the liver is the central organ for choline metabolism, and the embryonic liver of mice is not functional this early in gestation, we focused on choline metabolism in the liver of the dam. Methods: Using a bioinformatics approach, the goals were to assess whether (1) genetic differences in liver choline metabolism in the dam could affect ethanol-induced cell death in a genotype-specific manner and (2) any of these candidate genes in the liver of the dam could be linked to differential response to choline amongst the strains. By performing a literature review, haplotype analysis among the 4 BXD strains, and liver protein expression analysis among 3 strains, we show that there are genetic differences in choline metabolic genes that are consistent with the hypothesis that maternal choline metabolism could mediate differential sensitivity. Results: While we identified two genes as promising candidates for the variable responses to choline supplementation among the four previously identified BXD strains choline/ethanolamine phosphotransferase 1 (cept1) and choline transporter gene solute carrier family 44 member 1 (slc44a1), the wealth of data on slc44a1 makes it the stronger candidate and suggests that it should be further explored. Conclusions: Genetic differences in maternal choline metabolism are present and may underlie variable therapeutic responses to choline, warranting a hypothesis that requires further investigation across animal models and human populations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».