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Enregistrement W7117746507 · doi:10.64898/2025.12.30.696985

A whole-organ multi-scale in silico framework for human kidney haemodynamics informed by hierarchical phase-contrast tomography

2025· article· W7117746507 sur OpenAlexfundno aff
Yousef Javanmardi, Mengzhe Lyu, Yang Zhou, Yufei Wang, Claire Walsh, P. Tafforeau, Daniyal J. Jafree, Alexandre Bellier, Ryo Torii, Peter Lee

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typearticle
Langue
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced X-ray Imaging Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity College LondonNational Institute for Health and Care ResearchGreat Ormond Street Hospital for ChildrenEuropean Synchrotron Radiation FacilityRoyal Academy of EngineeringWellcome TrustMedical Research CouncilCanadian Institute for Advanced ResearchSilicon Valley Community Foundation
Mots-clésKidneyHemodynamicsRenal functionGlomerulusRenal blood flowRenal circulationBlood flowPerfusionStenosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Studying human kidney haemodynamics has been limited by the absence of complete vascular maps of the whole organ. Here we utilise previously generated multi-resolution hierarchical phase-contrast tomography (HiP-CT) coupled with a hybrid anatomically-grounded synthetic reconstruction to generate a full arterial–glomerular network of an intact human kidney comprising 1.6 million vessels and over 800,000 glomeruli. Using this anatomically comprehensive structure, we apply physics-based zero-dimensional haemodynamic modelling to quantify blood pressure, flow and simulated filtration rate across the entire organ. We show that the reconstructed human kidney vascular network exhibits order-dependent branching behaviour similar to that of rat kidneys, and that physiologically plausible pressure and flow patterns are recovered only when the full vascular network is represented. We further demonstrate how the kidney responds to macrovascular and microvascular perturbations, including stenosis of the large renal arteries and narrowing or ablation of afferent arterioles. Stenosis and arteriole narrowing exhibit threshold-type behaviour, with kidney perfusion and simulated glomerular filtration rate remaining largely preserved up to ∼50% narrowing, followed by sharp nonlinear declines beyond ∼70%. These predictions emerge in the absence of autoregulatory mechanisms, indicating that vascular geometry and resistance scaling alone contribute to kidney functional deterioration. Together, our framework provides the first organ-wide, data-driven model of human kidney haemodynamics and offers a foundation for future studies of kidney physiology and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,532
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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