A pipeline for comparing and combining TSPO‐PET tracers in Alzheimer's disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Neuroinflammation is a key pathological driver of neurodegenerative diseases, including Alzheimer's disease (AD). Positron emission tomography (PET) with tracers targeting the translocator protein (TSPO) enables the in vivo quantification of microglial activation. Currently, direct comparison between TSPO‐PET tracers in AD have not been performed. Here, we tested a pipeline to quantitatively compare different TSPO‐PET tracers in clinically‐matched cohorts of patients with AD across multi‐centre data. Method 32 people with AD and 15 controls underwent [ 11 C]PK11195‐PET at the University of Cambridge, 45 people with AD and 19 controls underwent [ 18 F]GE180‐PET at Ludwig‐Maximilians‐University of Munich, and 25 people with AD and 25 controls underwent [ 11 C]PBR28‐PET at McGill University. Participants across the centres were matched for age, sex, and clinical severity. Pre‐processing of scans was harmonised across centres, and regional SUVr of tracers were obtained using a shared reference region and atlas. Z‐scores of regional SUVr values for each participant were calculated based on centre‐specific controls. Dissimilarity and clustering analyses were performed to assess the effectiveness of the standardisation pipeline. Figure 1 outlines the methodology. Result Clustering analyses identified no tracer‐specific patterns in the distribution of z‐scores following standardisation. Across all tracers, regional z‐scores of the AD groups were significantly different between tracers in 7 of 41 brain regions, while no differences were found for controls (Figure 2). Full factorial analysis found a main effect of tracer; however, these were due to interaction effects with disease group, sex, age, and brain region and explained very little of the variance. Pattern similarity between representational similarity matrices found moderate correlations between the three tracers in patient and control groups. Conclusion These results suggest that our pipeline is effective at harmonising TSPO‐PET tracers and standardising the regional quantification of microglial activation in the context of different AD cohorts. Dissimilarity analyses identified small tracer‐specific effects, however. Ongoing work aims to optimize this pipeline in order to compare and combine TSPO‐PET tracers in other tauopathies (ie PSP) and to identify thresholds of “inflammation severity” related to clinical outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,015 | 0,024 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».