Genetic and Environmental Factors Influencing Infectious Bronchitis Virus and Vaccine Responses in Layer Chickens
Notice bibliographique
Résumé
Infectious bronchitis virus (IBV) is a continuous challenge to poultry health and productivity worldwide despite widespread vaccination. This thesis investigated mechanisms of IBV variation, how IBV variation and environmental stressors particularly drinking water quality influence IBV infection and vaccine mediated immune response in layer chickens. First, genetic analysis of two newly detected Canadian IBV strains showed that both IBV strains were recombinants, likely arising from recombination between vaccine and field IBV strains. These viruses carried many changes in the spike (S) protein, including in important variable regions, and showed stronger binding to host cell receptors. We also discovered that infectious bronchitis (IB) vaccination can contribute to the evolution of new IBV variants. Second, we compared the pathogenicity of two IBV strains commonly present in Canadian poultry flocks, Massachusetts (Mass) and Delmarva (DMV/1639). The DMV/1639 IBV strain caused more severe disease, with higher drop in egg production, higher viral loads in tissues, more gross lesions, higher histopathological lesions, and increased cell death compared to the Mass IBV strain. Third, we assessed how water quality affects vaccine responses. A cross-sectional study across Alberta revealed that many flocks use water exceeding recommended limits for hardness, pH, sodium, and bicarbonates. Although no clear associations were seen at the farm level, controlled experiments confirmed that birds vaccinated while drinking poor-quality water developed lower antibody titers and reduced T-cell responses compared to those receiving tap water, which was used as the standard-quality water. Finally, we tested whether poor drinking water quality could worsen the outcome of IBV infection in chickens. The chickens given field water with higher pH, hardness, and bicarbonates showed higher viral loads and weaker immune responses compared to those given standard tap water, suggesting that suboptimal quality of drinking water can increase IB severity. Together, these studies show that both viral evolution and environmental factors such as water quality play important roles in IBV infection outcomes and IB vaccine effectiveness. Monitoring emerging IBV variants and improving water management are important steps for protecting poultry health and productivity in Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».