Novel CSF astrocyte biomarkers are associated with amyloid load in Alzheimer's disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Astrocytes are highly involved in Alzheimer's disease (AD) pathophysiology. GFAP, an astrocyte‐enriched protein, increases in response to amyloid (Aβ) pathology and is used as a fluid biomarker of astrocyte reactivity in AD. However, GFAP does not fully reflect the astrocytic dynamics in response to the disease. Thus, we aimed to identify novel astrocyte biomarkers in CSF that contribute to the understanding of the pathological changes in AD. Method We analyzed CSF proteomic data from 728 individuals in the ADNI cohort (SomaLogic). A pre‐defined list of 30 astrocyte‐enriched genes was contrasted with the available ADNI CSF proteomic data, resulting in eight proteins of interest, including GFAP. We examined their CSF levels across cognitively unimpaired (CU), mild cognitively impaired (MCI), and AD individuals (Figure 1a). The proteins levels in CSF were further investigated in CU and cognitively impaired (CI) individuals who were also categorized according to their Aβ status (ptau181/Aβ42 ratio cut‐off=0.028, Figure 1b). Voxelwise models assessed associations between the selected proteins and [ 18 F]Florbetapir‐PET, a biomarker of Aβ deposition, in a subset of the individuals ( n = 461), and CU and CI individuals separately. Models also included age and sex, and RFT was used for multiple comparisons correction in the imaging analyses. Result CSF NCAN was significantly reduced in AD individuals compared to CU and MCI (Figure 1a). Further analysis revealed elevated CSF GPC5 levels in Aβ‐positive CI (CI Aβ+) compared to Aβ‐negative CU (CU Aβ‐) and CI (CI Aβ‐) groups. In contrast, CSF LRIG1 and NCAN were only increased in CI+ compared to CI‐ individuals (Figure 1b). Positive associations were observed between CSF GPC5, LRIG1, and NCAN, and [ 18 F]Florbetapir‐PET, with GPC5 showing the most widespread cortical associations, particularly in CI individuals (Figure 2). Conclusion This study identifies GPC5, LRIG1, and NCAN as CSF astrocyte biomarkers altered across AD cognitive status and amyloid pathology. GPC5, in particular, showed the most widespread cortical association with Aβ deposition, consistent with its role in synaptic maturation and stabilization. Given that GPC5 is highly expressed in cortical astrocytes, these findings highlight its potential as a novel astrocytic biomarker in AD. Further validation will be conducted in an external cohort.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».