Accuracy of an Automated Plasma Apolipoprotein E4 Proteotyping Immunoassay for Determination of <i>APOE</i> Genotype
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Anti-amyloid therapies (AAT) for Alzheimer's disease are associated with the risk of amyloid-related imaging abnormalities (ARIA). APOE4 homozygotes (E4/E4) have the highest risk, followed by APOE4 carriers (E4), making APOE genotyping essential for risk assessment. While APOE4 allelic status is routinely determined via DNA (e.g., by RT-PCR), recently developed automated immunoassays offer an alternative approach by measuring the apolipoprotein E4 (apoE4) concentration in plasma (i.e., proteotyping). In this study, we evaluated the diagnostic accuracy of an apoE4 proteotyping assay (Fujirebio Lumipulse) and its suitability for ARIA risk assessment. METHOD: This diagnostic accuracy study included 104 plasma samples from unique individuals with known APOE genotypes determined by RT-PCR: E2/E3 = 8, E3/E3 = 45, E2/E4 = 1, E3/E4 = 44, and E4/E4 = 6. Plasma samples were analyzed using Fujirebio's Lumipulse G1200 system with the Lumipulse G ApoE4 and Pan-ApoE assays. These assays measure apoE4 and total apoE protein concentrations, respectively, and their ratio is used to infer E4 allelic status (non-E4, E4, or E4/E4). The assays were further evaluated for precision, potential interferences, and sample stability across freeze/thaw cycles. RESULT: The plasma proteotyping assay demonstrated 100% accuracy in distinguishing the presence or absence of an E4 allele compared to RT-PCR. It correctly classified all non-E4 individuals (n = 53), all E4/E4 (n = 6), and 41 of 45 E4 heterozygotes (4 heterozygotes were misclassified as E4/E4). The ApoE4 and Pan-ApoE assays had total coefficients of variation of 8.5% and 4.0%, respectively. No significant interference was observed for hemolysate up to ∼5.25 g/L of hemoglobin or for lipemia up to ∼500 mg/dL of intralipid. Additionally, freeze-thaw testing showed no significant impact on assay performance for up to 4 freeze/thaw cycles. CONCLUSION: The evaluated plasma apoE4 phenotyping assay demonstrated perfect accuracy in detecting the presence or absence of an E4 allele. However, it did not reliably distinguish E4 heterozygotes from homozygotes, with several heterozygotes misclassified as E4/E4. In the context of AAT treatment eligibility and ARIA risk assessment, proteotyping is an accurate method for both ruling in and out the presence of an E4 allele but E4/E4 results specifically should be confirmed via genotyping.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».