The most informative loci to identify trunk disease pathogens associated with grapevine and perennial fruit and nut crops
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Trunk disease (TD) fungi are taxonomically diverse, and accurate species delimitation relies on multilocus phylogenetic analyses. However, the loci commonly employed vary among fungal groups, leading to inconsistencies in species recognition. This paper provides a comparative overview of the most informative genetic loci for species identification within the main families associated with TDs, including Botryosphaeriaceae, Cytosporaceae, Diaporthaceae, Diatrypaceae, Phaeomoniellaceae, Togniniaceae, Nectriaceae (Ascomycota), and Hymenochaetales (Basidiomycota). The internal transcribed spacer region (ITS) remains the universal primary barcode, but its discriminatory power is often limited. The most informative loci [translation elongation factor 1-α (tef1), β-tubulin (tub2), actin (act1), calmodulin (cal), histone (his3), and the RNA polymerase II second largest subunit (rpb2)] are identified, and optimal locus combinations for each fungal group are identified. This synthesis will aid selection of the most appropriate loci for robust phylogenetic inference and accurate pathogen identification, thereby improving epidemiological and management studies of TDs.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle