Synthesis of long and functionally active RNAs facilitated by acetal levulinic ester chemistry
Notice bibliographique
Résumé
Recent advances in RNA-based therapeutics have created a demand for synthetic RNAs that are 100 nucleotides (nts) or longer. In this study, we present the use of 2'-acetal levulinic ester (2'-ALE) phosphoramidites for the synthesis of long RNAs that are at least 215 nts in length. We have developed protocols for rapid (2-4 min) and efficient coupling (>99%) of 2'-ALE monomers and established a rapid, on-column deprotection of RNA strands requiring short alkylamine treatments at room temperature. The results of these studies enabled the successful syntheses of sgRNAs (99 nt), sgRNA tagged with fluorogenic Mango II and Broccoli aptamers (130-170 nt), and 5'-capped minimal mRNAs (200-215 nt), each exhibiting robust functional activity in both cell-free and cellular systems. We also found that the incorporation of 2'-O-methyl-adenosine in the poly(A) tail of synthetic mRNAs markedly enhanced protein expression, highlighting the ALE platform's compatibility for systematic exploration of RNA chemical diversity. Collectively, these results establish 2'-ALE chemistry as a promising platform for the synthesis of long and functionally active RNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».