Étude moléculaire de l'interaction entre les bactériophages de Clostridioides difficile et leur récepteur cellulaire, la protéine de surface SlpA
Notice bibliographique
Résumé
The emergence of hypervirulent strains of Clostridioides difficile, a leading cause of nosocomial infections in industrialized countries, underscores the urgent need for new therapeutic strategies. Among them, phage therapy, which relies on the use of bacteriophages specifically targeting bacteria, has regained interest. However, its application against C. difficile remains limited by our incomplete understanding of the molecular mechanisms involved in host recognition by phages. This thesis aimed to elucidate the molecular basis of the interaction between C. difficile-infecting phages and their principal receptor identified to date, the surface layer protein SlpA, the major component of the S- layer. In a first study, using the epidemic strain R20291 and its derivative FM2.5, a natural mutant lacking slpA, we demonstrated that the absence of SlpA confers complete resistance to several phages, and that sensitivity can be restored by reintroducing slpA via a plasmid. Furthermore, complementation of FM2.5 with 12 different slpA isoforms revealed a high specificity of interaction between isoforms and the tested phages. In the second part, we identified the regions of this receptor critical for phage recognition. SlpA is cleaved into two fragments: a high- molecular-weight (HMW) subunit anchored to the cell surface and a low-molecular-weight (LMW) subunit exposed externally, itself divided into two domains, D1 and D2. We generated targeted bacterial mutants, including complete and partial deletions of domain D2, chimeric constructs between isoforms, and variants expressing only the HMW fragment. Infection and adsorption assays highlighted a key role of domain D2 in recognition by certain phages. Chimeras further showed that efficient interaction generally requires the isoform- specific combination of both fragments, suggesting recognition based on fine structural determinants unique to each isoform. Overall, this work improves our mechanistic understanding of phage–SlpA interactions in C. difficile and, more broadly, of phage–S-layer interactions. It paves the way for the design of broad-spectrum phage cocktails and recombinant phages targeting refractory strains, to develop personalized therapies against recurrent C. difficile infections.
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».