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Enregistrement W7124924134 · doi:10.59275/j.melba.2025-fcb7

A schistosomiasis dataset with bright- and darkfield images

2025· article· en· W7124924134 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDigital Imaging for Blood Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSchistosomiasisFreshwater molluscHelminthiasisBiomphalaria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schistosomiasis is a neglected tropical disease (NTD) that threatens 700 million and impacts 250 million people per year.The disease is caused by blood flukes of the genus Schistosoma, which enter the human body through contact with infected water.One species, S. haematobium, sheds eggs through the urinary tract, and can thus be diagnosed by examining urine samples for these eggs.Because concentrations of schistosomiasis infection are highly localized and are often in remote areas, rapid and robust field diagnosis is crucial to both individual diagnosis and the mapping that informs control efforts.Artificial intelligence (AI) algorithms, if properly designed, can speed up and improve both diagnosis and mapping through scalable, accurate analysis of images of urine samples.To develop such algorithms, we offer the dataset described here.It consists of paired bright-and darkfield images of urine samples collected in two distinct field studies in Cte d'Ivoire, Africa.There are images from 728 patients, of whom 151 were schisto-positive and contain S. haematobium eggs.Crucially, each patient has sufficient images to diagnose S. haematobium infection, so the dataset can be used to realistically test the diagnostic value of algorithms for clinical use.The division into two studies allows testing of algorithm generalizability.Due to exigencies of the data collection protocol, the images display a variety of qualities, from clear to blurry, which further allows testing of algorithm robustness to realistic noise.The dataset is thus well-suited to developing algorithms that can be of concrete value in schistosomiasis control efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,942
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle