Amplicon-Based 16S rRNA Inventory of a Laboratory-Cultivated Hypersaline Halophilic Biofilm from Indonesian Salt Ponds: A Descriptive Pilot of Bacterial–Archaeal Composition
Notice bibliographique
Résumé
Hypersaline environments support microbial communities with remarkable adaptations to osmotic stress, yet the ecological organization of biofilm-associated microbiomes in these habitats remains poorly understood.This study presents the first amplicon-based 16S rRNA characterization of a laboratory-grown halophilic biofilm derived from Indonesian salt ponds.Biofilm biomass from salinity stages of approximately 2%, 20%, and 40% NaCl was pooled prior to DNA extraction to ensure sufficient yield; therefore, the present study provides a descriptive community inventory rather than comparisons among salinities or biofilm baseline inventory.High-throughput sequencing identified 196 OTUs (Good's coverage = 0.9997) with moderate-to-high richness across alphadiversity indices.The community was dominated by bacterial genera including Oceanicaulis, Bacillus, Halomonas, and Limimaricola, alongside archaeal taxa such as Haloferax and Halohasta.These taxa are discussed in relation to ecological functions reported in prior hypersaline biofilm studies; however, spatial stratification cannot be inferred from a composite sample.Overall, this work provides baseline taxonomic data for Indonesian salt-pond-derived halophilic biofilms and motivates future spatially resolved and functional validation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».