Immune Gene Expression & Thymus Development as Indicators of Immunocompetence in Lumpfish, Cyclopterus lumpus, L.
Notice bibliographique
Résumé
Sea lice, namely Lepeophtheirus salmonis (Krøyer, 1837), are a significant threat to the financial and biological success of farmed Atlantic salmon and are one of the top contributors to economic losses in the industry. The use of lumpfish, Cyclopterus lumpus L., as cleaner fish in salmon net pens has increased recently in Europe and Atlantic Canada, due to their demonstrated efficacy in controlling sea lice. To mitigate associated threats to fish welfare and biosecurity, aquaculture operations producing lumpfish must closely monitor the fishes’ health and vaccinate them against harmful pathogens. An optimal vaccination regime has yet to be determined, as the understanding of lumpfish immune system development and adaptive immune response is still in its infancy. This project aims to identify and investigate the expression of genes directly related to the development of the lumpfish immune system and adaptive immune response, to establish when during development lumpfish become immunocompetent. Methodology includes gene expression analysis of immune genes: secretory immunoglobulin M (sIgM), T-cell receptor alpha (TCR a), and major histocompatibility complex II beta (MHCII b), and histological assessment of thymus development in lumpfish ranging from approximately -8 days post hatch (DPH) to 34 DPH. Gene expression results indicated significant differences in expression of sIgM between -8 DPH and all other sampled timepoints, and between 0 and 34 DPH. There was no significant difference of TCRa expression across sampled timepoints. Significant differences in expression of MHCII b were observed between 34 DPH and all other sampled timepoints, and between days 4-8 and days 19-31. Histopathology of the developing thymus indicated first instance of thymus presence at 4 DPH with potential zonation appearing at 23 and 29 DPH. These findings suggest the possibility of adaptive immunocompetence closely following 34 days post hatch, with significant expression of sIgM in the egg indicating potential evidence of maternal transfer. Significant upregulation of MHCII b at 34 DPH following thymus zonation could also indicate the beginning of lymphoid capabilities of the thymus and T-cell activity near or after this point of early development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».