DISSECTION OF THE REGULATIVE CONTROL OF MADS69, A GENE UNDERLIESA MAJOR FLOWERING TIME QTL, VGT3
Notice bibliographique
Résumé
Flowering time is an essential adaptative trait for crop breeding to local environments. A major quantitative trait locus (QTL) for flowering time and number of nodes, qVgt3.05 (Vgt3) was previously identified on chromosome 3 using a cross between the elite line B73 and the extremely early flowering Canadian –origin landrace Gaspé Flint. The same locus was shown to control flowering time in independent studies Vgt3 was finely mapped to a 380-kb genomic region including the known flowering time gene Mads69 by positional cloning. Comparison of genomic sequences between Gaspé Flint and B73 identified no difference in Mads69 coding sequences. The involvement of Mads69 in flowering time gene was confirmed by overexpression and downregulation experiments. Comparative genomics analysis showed that Mads69 RNA expression variation, both in terms of quantity and alternative splicing, associated with structural variation (transposon insertions) at its first intron. The earliness-inducing allele carried by Gaspé Flint appears of ancient origin, is present in tropical maize and likely contributed to adaptation to high-land and high-latitude environments, whereas the late-inducing allele was likely subsequently derived by transposon insertions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».