MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7132459009

DISSECTION OF THE REGULATIVE CONTROL OF MADS69, A GENE UNDERLIESA MAJOR FLOWERING TIME QTL, VGT3

2022· article· en· W7132459009 sur OpenAlexaboutno aff
Tassinari C. A., FORESTAN C., EMANUELLI F., Tuberosa R., SALVI S.

Notice bibliographique

RevueArchivio istituzionale della ricerca (Alma Mater Studiorum Università di Bologna) · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocus (genetics)AlleleGeneQuantitative trait locusFlowering Locus CTransposable elementArabidopsisGenomicsChromosome
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flowering time is an essential adaptative trait for crop breeding to local environments. A major quantitative trait locus (QTL) for flowering time and number of nodes, qVgt3.05 (Vgt3) was previously identified on chromosome 3 using a cross between the elite line B73 and the extremely early flowering Canadian –origin landrace Gaspé Flint. The same locus was shown to control flowering time in independent studies Vgt3 was finely mapped to a 380-kb genomic region including the known flowering time gene Mads69 by positional cloning. Comparison of genomic sequences between Gaspé Flint and B73 identified no difference in Mads69 coding sequences. The involvement of Mads69 in flowering time gene was confirmed by overexpression and downregulation experiments. Comparative genomics analysis showed that Mads69 RNA expression variation, both in terms of quantity and alternative splicing, associated with structural variation (transposon insertions) at its first intron. The earliness-inducing allele carried by Gaspé Flint appears of ancient origin, is present in tropical maize and likely contributed to adaptation to high-land and high-latitude environments, whereas the late-inducing allele was likely subsequently derived by transposon insertions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArchivio istituzionale della ricerca (Alma Mater Studiorum Università di Bologna)Même sujetGenetic Mapping and Diversity in Plants and AnimalsTravaux en français237 207