Characterizing a Novel Phage Tail-Like Bacteriocin in Salmonella and Escherichia
Notice bibliographique
Résumé
Bacteriophage tail-like bacteriocins, or tailocins, are phage tail-like particles that facilitate interbacterial competition. They are evolutionarily and structurally related to phage tails, and have evolved numerous times from different phages throughout several bacterial classes. In this work, I present a comprehensive analysis of a novel tailocin cluster that we identified in Salmonella and Escherichia. I demonstrate that this tailocin cluster is conserved throughout several S. enterica subspecies, and that it is conserved at the same locus in the closely related genus Escherichia. I define the essential components of this tailocin, describe several features that are novel in the context of tailocin biology, and demonstrate that this tailocin can be classified into groups on the basis of its receptor binding proteins. I then focus on tailocin regulation in Salmonella, showing that this tailocin is DNA damage-inducible and characterizing expression from several tailocin promoters. I identify the tailocin transcriptional regulator, and I illustrate that overexpression of this regulator can be used to specifically induce tailocin production for downstream characterization. This work expands upon a previously unappreciated aspect of Salmonella and Escherichia biology, and lays the groundwork for further tailocin characterization in these genera.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».