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Enregistrement W7132884031

Application of quantitative structure-toxicity relationships to quinone-induced cellular oxidative stress

2004· dissertation· W7132884031 sur OpenAlexafffund
Arno Garakhanian Siraki

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2004
Typedissertation
Langue
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueBioactive Compounds and Antitumor Agents
Établissements canadiensBibliographical Society of Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCytotoxicityReactive oxygen speciesCatalaseQuinoneOxidative stressHepatocyteIntracellularEnzyme
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxidative stress can be defined as a level of reactive oxygen species (ROS) formation that overcomes the threshold of cellular detoxification processes, which results in cellular damage. In chapter 1 of this study, we first examined intracellular sources (organelles) for "natural" formation of ROS, by using chemicals that are endogenously found. We determined that substrates metabolized by enzymes associated with mitochondria, peroxisomes, and endoplasmic reticula, formed ROS that lead to cytotoxicity, which became enhanced after catalase inhibition. A correlation between ROS formation and cytotoxicity was found, which led us to study this correlation using xenobiotics. In chapter 2, we examined ROS formation and cytotoxicity induced by a congeneric family of quinones and used quantitative structure-toxicity relationships (QSTRs) to analyze these results for both isolated rat hepatocytes and rat PC12 cells. A two dimensional (2D) QSTR or Hansch analysis was used to derive (multiple) linear regression equations for the cytotoxicity towards both cell types. This analysis identified electron affinity (or electrophilicity) of the quinone as the critical parameter responsible for the observed cytotoxicity and ROS formation. In chapter 3 we determined the effect of inhibiting NAD(P)H:Quinone Oxidoreductase (NQO), involved in a 2e- quinone reduction, with dicumarol on quinone cytotoxicity and ROS formation. Interestingly, apparent NQO inhibition affected hepatocyte susceptibility to quinones much more than PC 12 cells, which had little NQO activity relative to hepatocytes. Some quinones formed more ROS and were more cytotoxic to NQO inhibited hepatocytes, whilst other quinones were not affected. We derived 2D and three-dimensional (3D) QSTRs and found that both approaches yielded statistically significant models; but the 3D QSTR models were much more accurate. In the last chapter, we identified the bicarbonate anion (HCO3- ) as an important modulator of ROS formation and cytotoxicity. The effect of HCO3 - was titratable, and increased the cytotoxicity of redox cycling quinones, but not alkylating quinones. A carbonate radical mediated cytotoxic mechanism is proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,465
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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