The Epidemiology of Carbapenemase-Producing Enterobacterales (CPE) Associated with Long-Term Care in Toronto and Peel Region
Notice bibliographique
Résumé
Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) are multidrug-resistant pathogens of growing concern. We analyzed population-based surveillance data from the Toronto Invasive Bacterial Diseases Network (TIBDN) from 2007–2023 to assess CPE in long-term care homes (LTCHs) in Toronto and Peel. We reviewed hospitalization/travel histories and laboratory data to identify colonized/infected persons linked to LTCHs, determine their likely source of acquisition, and assess whether they were colonized in LTCHs before/after detection. Whole-genome sequencing (WGS) was used to test epidemiological hypotheses regarding transmission sources. Of 57 LTCH-linked cases, 5 were likely acquired in LTC, 7 abroad, 21 in local hospitals, and 24 had unknown sources. Twenty-six were colonized while residing in LTC. Single nucleotide variant (SNV) analysis confirmed clonal transmission to patients that conventional epidemiology missed and ruled out other cases, underscoring the value of integrating genomics into epidemiological investigations. Our findings support the need for targeted screening and infection control in LTCHs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».