A comparison of gene expression pattern in OSCC between young and older individuals, with emphasis on GSTP1 and the Fanconi anemia genes
Notice bibliographique
Résumé
Distinct genetic mechanisms may be involved in the development of OSCC in young versus older patients. We used microarray analysis to identify genes differentially expressed in the two patient groups. We performed QRT-PCR to assess the expression of GSTP1, FANCA, FANCC, FANCD2 and FANCG in OSCCs and adjacent mucosa from both groups. GSTP1 was under-expressed in tumors of young patients compared to adjacent mucosa (p=0.007). Both GSTP1 and FANCA had lower expression in tumors of young compared to older patients (p=0.020, p=0.005). By immunohistochemistry, GSTP1 expression was low in 40.5% of young compared to 5% of older patient tumors (p=0.002). FANCG expression was low in 81% of young compared to 37.5% of older patient tumors (p<0.001). GSTP1 plays a key rote in detoxification mechanisms and FANCA in DNA repair. Under-expression of these genes may contribute to carcinogenesis in tumors of young patients, in contrast to OSCC from older patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».