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Enregistrement W7132901842

The Effect of TRPML1 Inhibition by Helicobacter Pylori Vacuolating Cytotoxin on Mitochondrial Dynamics and Function

2024· dissertation· W7132901842 sur OpenAlexaff
Julia Marie Novielli

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2024
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalcium signaling and nucleotide metabolism
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrionmitochondrial fusionMitochondrial fissionLysosomeHelicobacter pyloriOrganellePopulationMembrane potentialIntracellular
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Helicobacter pylori inhabits the stomachs of ~50% of the world’s population and is one of the leading causes of gastric cancer. H. pylori releases virulence factors, including the vacuolating cytotoxin A (VacA) which is strongly associated with disease. VacA provides H. pylori with the ability to establish chronic infection and disrupts host organelle function, particularly lysosomes and mitochondria. VacA impairs lysosomes by inhibiting transient receptor potential membrane channel 1 (TRPML1), forming non-degradative lysosomes that serve as intracellular survival niches for bacteria. Mitochondria orchestrate essential cell functions and are dependent on their ability to undergo fusion or fission, referred to as mitochondrial dynamics. Mitochondria are pivotal for regulation of lysosomal activity, as alterations in mitochondrial proteins or changes in dynamics hinder lysosome function. Conversely, defects in TRPML1, can impair mitochondrial function. The primary aim of this investigation was to determine the effect of VacA on mitochondrial dynamics and function upon long-term exposure. The results of this study show that VacA induces mitochondrial elongation after 24 hours which can be prevented with treatment of the TRPML1 agonist ML-SA1. While investigation into the mechanism behind VacA-induced mitochondrial elongation is ongoing, we have shown that it is independent of the mitochondrial fission protein dynamin-related protein 1 (Drp1) but involves altering mitochondrial fusion by increasing the ratio of long to short Optic Atrophy 1 (OPA1) isoforms. Furthermore, this study demonstrates that prolonged VacA exposure leads to mitochondrial dysfunction, evidenced by a reduction in mitochondrial transmembrane potential. Notably, ML-SA1 treatment was ineffective in preventing mitochondrial dysfunction in this context, suggesting that VacA's effects on mitochondria do not solely depend on its ability to inhibit TRPML1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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