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Enregistrement W7132904525

Hypostatin, a new small molecule inhibitor of plant cell expansion, is glyco-activated in vivo

2008· dissertation· W7132904525 sur OpenAlexfundno aff
Yang ZHAO

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2008
Typedissertation
Langue
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésPharmacogeneticsArabidopsisDrugSmall moleculeGenetic variationHypocotylGeneDrug actionIn vivo
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural variation in humans in the response to a bioactive or drug-like small organic molecule is defined as pharmacogenetic variation. Studies have shown that variation in both drug metabolism genes and drug target loci can cause inter-individual variation in drug response. For example, sequence differences in UDP-glucuronosyl transferases (UGTs), which glycosylate xenobiotics, can affect drug sensitivity by affecting rates of drug detoxification. Although this subject has been explored extensively in humans, the biological pervasiveness of pharmacogenetic variation had not been systematically examined. If pervasive, pharmacogenetic variation in model systems could be used for both functional studies and to gain deeper insight into the mechanisms of this important form of natural variation. To examine this question, 8 geographically diverse Arabidopsis accessions were screened on a 10,000 member chemical library. I focused on new inhibitors of cell expansion in the etiolated hypocotyl. In total, 742 chemicals (7.4%) caused greater than 20% inhibition of hypocotyl cell expansion. 11 weak polymorphic chemicals were uncovered, as well as a strong polymorphic hypocotyl cell expansion inhibitor, named hypostatin. My work has firmly established the existence of pharmacogenetic variation in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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