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Enregistrement W7132911394

Cloning and characterization of the invertebrate visual iG(q)alpha: Membrane association, receptor coupling efficacy and turnover

2007· dissertation· W7132911394 sur OpenAlexfundno aff
Lynle Go

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2007
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésPalmitoylationRhodopsinHEK 293 cellsG protein-coupled receptorProteolysisCytosolMembrane proteinPeptide sequenceReceptorTransport protein
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study reports the cloning and characterization of invertebrate visual iGqalpha membrane association, receptor coupling efficacy and turnover. iGqalpha relays signals from rhodopsin to phospholipase C leading to membrane depolarization. When its full-length cDNA from L. pealei was cloned, its deduced amino acid sequence was 77% identical to mammalian Gqalpha. Both G proteins are highly homologous and iGqalpha contained conserved N-terminal cysteine residues that can be palmitoylated, a GTP-binding motif, three SWITCH regions and a site for effector/receptor interactions in the C-terminus. The role of G protein palmitoylation remains unclear. My findings suggest that iGqalpha is palmitoylated but that this is not important for its initial membrane targeting. The palmitoylation-deficient iGqalpha(C3,4A) however, is unable to maintain membrane attachment following receptor activation. Thus activated iGga(C3,4A) could translocate from membrane to cytosol and mimicked the translocation of iGqalpha observed in intact invertebrate photoreceptors. The activation-dependent translocation of iGqalpha may act to regulate the amount of a subunits which can interact with activated rhodopsin therefore regulating photosensitivity in the invertebrate eye. While palmitoylated iGqalpha expressed in HEK 293T cells do not show any significant changes in protein levels in the basal and stimulated conditions, non-palmitoylated iGqalpha turnover, initially has a half-life of 20 hours under basal conditions and decreases to 10 hours upon agonist stimulation. Accelerated turnover of non-palmitoylated iGqalpha is attributed to increased degradation by the ubiquitin-proteasomal pathway. My findings demonstrate not only an activation-dependent and cellular localization-dependent proteolysis of a G protein, but also for the first time implicate the ubiquitin-proteasomal pathway in the degradation and turnover of a Gqalpha protein. Lastly, the receptor-interacting N-terminal domain contains a six amino acid extension MTLESI in mammalian mGqalpha that is not present in iGqalpha. I explored the function of MTLESI by testing its role in receptor specificity and efficacy. My findings suggest that the lack of MTLESI on iGqalpha increases its efficacy in coupling to G q-linked receptors but does not decrease its specificity. Furthermore, the mechanism by which the efficacy of iGqalpha is regulated appears to be at the level of guanine nucleotide exchange as demonstrated by increased GTPgamma[35S] binding of iGqalpha compared with mGqalpha.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
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Résumé présentoui

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