The Role of the ORB2 RNA-binding Protein in Post-transcriptional Regulation
Notice bibliographique
Résumé
RNA-binding proteins (RBPs) are key components of the post-transcriptional regulatory framework and can determine the translational fate of their RNA targets. A wide variety of post-transcriptional regulatory mechanisms are employed during the early Drosophila embryo and it has been established as a system well suited for the study of these mechanisms. In Drosophila, ORB2 is an RBP expressed in the early embryo. It has been shown to regulate translation of bound mRNAs, but relatively little is known about what RNAs it targets in early embryogenesis and the mechanisms by which it confers this regulation. In this thesis, I show that ORB2 associates with over 450 genes in the early embryo. Analysis of these genes shows that they are translationally repressed during the first two hours of development and are degraded during the maternal to zygotic transition (MZT). Using a dual luciferase assay, I show that ORB2 confers translational repression on a target mRNA and I map this repressive function to the C-terminal ZZ domain of the ORB2 protein. Next, I identify over 200 proteins which interact with ORB2 in the early embryo. This list of interactors includes protein components of the 43S preinitiation complex of translation initiation and components of the Cup repressive complex. I found that the ZZ domain is necessary for ORB2’s association with both complexes. Finally, I show that deletion of the ZZ domain of ORB2 causes major defects during the process of spermatogenesis. In these mutants, the localization of protein gradients to the apical tip of spermatid cysts is disrupted and the process of spermatid individualization fails to complete. These defects ultimately cause male sterility in these mutant flies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».