Notice bibliographique
Résumé
In this work, we discussed the importance of heat capacity in evaluation of thermodynamic parameters such as ΔG, ΔH and ΔS. We used DSC to measure directly changes in heat capacity accompanying unfolding of DNA from the promoters of the c-MYC, VEGF and Bcl-2 oncogenes. The most accurate means of determining heat capacity changes accompanying GQ unfolding is provided by DSC measurements. Although DSC has been used to determine changes in heat capacity accompanying duplex-to-single strand transitions, there has been a lack of similar studies of GQ. This study provided conclusive evidence of the existence of ΔCP in GQ unfolding. To further reiterate the dramatic effect that ΔCP has on thermodynamic parameters, the extrapolated values of ΔG, ΔH and ΔS were compared for ΔCP = 0 and ΔCP ≠ 0. When extrapolated to biologically relevant temperatures, the value of ΔG, when ΔCP is neglected, the error margin may be as large as 140%. Moreover, we designed a hairpin-based monomolecular DNA construct to further understand duplex-tetraplex equilibria. The sequence of the hairpin is derived from the c-MYC oncogene with the G-rich and C-rich strands by a T11 link. We used a CD-based approach to characterize the distribution of conformational states as a function of environmental conditions. Our work further reiterated the notion that both GQs and iM can exist in tandem.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».