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Enregistrement W7132926203

Robust Machine Learned Inter-atomic Potentials for Molecular Dynamics Simulations

2023· dissertation· W7132926203 sur OpenAlexaff
Gurjot Singh Dhaliwal

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSensitivity (control systems)Molecular dynamicsProperty (philosophy)Interatomic potentialReduction (mathematics)Bayesian probabilitySet (abstract data type)Uncertainty quantificationVariance (accounting)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular Dynamics (MD) simulations accelerated material discovery by performing property prediction at scales higher than Density functional theory (DFT). To make property prediction from MD simulations more robust, we propose an uncertainty quantification framework. The developed framework considers uncertainty in the parameters of the interatomic potential (IP) used to compute energy/forces between a set of atoms. We considered two distinct potentials namely AIREBO and Embedded atom method. The material of choice are graphene and aluminium. Sensitivity analysis was performed to understand the effects of IP parameter change on the final properties of interest. The sensitivity analysis showed that by varying the potential parameters as small as by 1%, the variance in the resulting mechanical properties was as high as 1e5. Basic properties such as elastic constant of graphene showed variation of 66% by changing AIREBO parameters only by 0.5%. Based on the sensitivity analysis results, a new robust version of each IP (AIREBO/EAM) was developed using Bayesian methodologies. Using samples from the resulting posterior distribution, MD simulations were performed and error bars for each property was obtained. The variance in the properties was within experimental tolerance exhibiting the reduction in sensitivity for both the material systems. It can be challenging to obtain a single classical IP to describe the interactions involved in multi-element systems. Various machine learning based potentials have been proposed to overcome this limitation however their computational cost can be high. The proposed model approximates the energy/forces using a linear combination of random features at a lower computational cost. This study provides results for three classes of materials, namely two-dimensional materials, metals, and semiconductors. Force and energy predictions made using the proposed method are in close agreement with density functional theory calculations, with training time that is 96% lower than standard kernel models. This study also develops IPs for High Entropy alloys based on random features. MD simulations for mechanical and thermal properties are within 7% of the corresponding DFT values. Complex interactions present at high temperatures were also correctly identified by the proposed IP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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