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Enregistrement W7132929454

The structure and assembly of gp80 cell adhesion complexes in Dictyostelium

2003· dissertation· W7132929454 sur OpenAlexafffund
Tony J Harris

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2003
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensBibliothèque et Archives nationales du QuébecUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésRaftDictyostelium discoideumLipid raftAdhesionCell adhesionDictyosteliumMembraneActin
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies on the Dictyostelium adhesion molecule gp80 have revealed the association of gp80 with lipid rafts and the assembly process of raft-based adhesion complexes. Membrane rafts were isolated from Dictyostelium cells as both Triton X-100-insoluble membranes and plasma membrane fragments using a detergent-free method. Each complex contained gp138, DdCD36, gp80, actin and ponticulin. Similar to vertebrate rafts, many of the Dictyostelium raft proteins were acylated and the raft membrane fractions were enriched with sterols. The raft membranes shared properties with isolated Dictyostelium contact regions, suggesting that rafts function in gp80-mediated adhesion. Moreover, gp80 colocalized with raft proteins and lipids at cell-cell contacts and sterol sequestration inhibited gp80-mediated adhesion. To elucidate how gp80 adhesion complexes are assembled, gp80-gp80 and gp80-raft interactions were investigated. Chemical cross-linking experiments revealed that rafts were enriched with gp80 oligomers. For other glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored proteins, lipid-lipid interactions between their anchors and the rafts can cluster the proteins. In contrast, gp80 oligomers resisted sterol sequestration, suggesting that, in addition to raft compartmentalization, other factors are involved. Indeed, gp80 oligomerization was mediated by direct gp80-gp80 interactions and gp80 existed predominantly as cis-oligomers. The enrichment of these species in the raft domains may facilitate the establishment of high avidity trans-interactions during the initial stage of adhesion complex assembly. In many adhesion complexes, receptors also form links to the cytoskeleton via cytoplasmic adaptor proteins. For the Dictyostelium contact regions, the raft component ponticulin was found to mediate interactions with the actin cytoskeleton. Intriguingly, gp80 and ponticulin appeared to interact indirectly through their mutual association with membrane rafts. Studies using gp80 and ponticulin null mutants suggested that gp80 was able to produce large, nascent, cytoskeleton-free adhesion complexes. gp80 also recruited ponticulin into rafts and to cell-cell contacts and was required for formation of the cytoskeleton-associated complexes. Thus, gp80-gp80 interactions might enlarge and stabilize associated rafts to recruit ponticulin and elevate raft-cytoskeleton interactions. A model is proposed for the assembly of GPI-anchored adhesion molecule complexes through reciprocal raft-receptor interactions: rafts facilitate initial receptor interactions that then enlarge and stabilize the rafts to induce signaling and cytoskeleton recruitment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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