Characterization of VPS33B and VPS16B in α-Granule Biogenesis in Megakaryocytes
Notice bibliographique
Résumé
Platelets contain storage vesicles known as α-granules, made by their precursor megakaryocytes. Loss of α-granule biogenesis causes arthrogryposis, renal dysfunction and cholestasis syndrome when VPS33B, encoding vacuolar protein sorting-associated protein 33B (VPS33B), or VIPAS39, encoding VPS33B-interacting protein apical-basolateral polarity regulator spe-39 (VPS16B), undergo loss-of-function mutations. VPS33B and VPS16B form a complex, which I hypothesize interacts with other proteins to facilitate α-granule cargo sorting and synthesis. Using a VPS33B antibody, I localized this protein within primary human megakaryocytes via confocal immunofluorescence microscopy. This represents the first time that endogenous VPS33B has been localized in megakaryocytes, removing the potential for experimental artefacts present in previous fusion-tagged imaging attempts. I have also investigated the interactome of VPS33B using a combination of affinity purification mass spectrometry analysis and co-immunoprecipitation experiments. These experiments identified several novel VPS33B interactors, including proteins involved in early and late endosomal trafficking pathways, and in the regulation of cytoskeletal networks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».