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Enregistrement W7132937231

Assessing ER Positive Breast Cancer Heterogeneity and Identification of Tumour Microenvironment Molecular Markers in Response to Treatment Via Multi-omic Approach

2024· dissertation· W7132937231 sur OpenAlexafffund
Crystal Gouravski

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2024
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésBreast cancerLetrozoleExemestaneMalignancyCD44DiseaseTumor microenvironmentCancer
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer (BC) remains the most prevalent malignancy among women. It is a heterogeneous disease and this in part, explains why most current therapeutics work best when multiple agents are combined. In this study, patients from the neoadjuvant trial of pre-operative exemestane or letrozole +/-celecoxib in the treatment of ER positive postmenopausal early BC (NEO-EXCEL) were profiled by targeted sequencing and spatial proteomic analysis to measure and assess the role of heterogeneity on treatment outcome. In matched samples, genes most frequently mutated included PIK3CA, NQO1, and MAP3K1. Frequent copy number changes in FGF3, FGF4, and FGF19 were identified. No significant differences were noted between pre- and post-treatment samples. Spatial profiling identified high-expressing proteins fibronectin, SMA, CD127, and CD44 in both tumour and TME compartments. Within the non-responders, lower levels of T-cells and macrophages were present. Uncovering the drivers of heterogeneity through a multi-omic study will help understand its effects on tumour progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,305
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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