Notice bibliographique
Résumé
Although proton-transfer reactions are ubiquitous in chemistry and biology, their theoretical study is limited by number of difficulties. Some of the practical challenges involving the study of proton-transfer reactions include the fact that accurate descriptions of hydrogen-bonded systems require time-consuming ab initio electronic structure methods. Computer time limitations become particularly relevant when investigating “rare events” such as chemical reactions, especially when the reactions are accompanied by substantial differences in the structure of the solvent. In addition, the proton is the lightest nucleus and nuclear quantum effects must be described adequately in proton-transfer reactions. The problems mentioned above are addressed by proposing methodological improvements to calculate reaction rates for proton-transfer reactions. A new ab initio Monte Carlo algorithm is proposed in which a much faster molecular mechanics potential “guides” the slow ab initio electronic structure simulation resulting in significantly more efficient sampling schemes compared to the more familiar ab initio molecular dynamics methods. The molecular mechanics guided sampling method is generalized to incorporate nuclear quantum effects via centroid transition state theory and solvent effects via hybrid quantum mechanics-molecular mechanics methods. The use of the molecular mechanics based importance function method is exemplified in a study of model intra-molecular proton-transfer reactions which investigates how molecular mechanics potentials should be created in order to predict kinetic isotope effects and reaction mechanisms correctly, and to understand the conditions in which atoms other than the hydrogen atom should be treated quantum-mechanically.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,013 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».