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Enregistrement W7132950710

Immunotherapeutic Approaches to Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas

2021· dissertation· W7132950710 sur OpenAlexaff
Dilakshan Srikanthan

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2021
Typedissertation
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemImmunotherapyMicrogliaTumor microenvironmentGliomaAntigenCancer immunotherapyAntibodyCell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) is a lethal brain tumour for which there are no effective therapies. Recently, immunotherapy has emerged as a promising therapeutic option for solid brain tumours, but its implementation requires an in-depth understanding of the immune landscape and the identification of protein targets. To date, the immune landscape of DIPG has been poorly defined with controversies around cell identities and activation states and various protein targets have been identified however with limited efficacy. Our analysis of RNA sequencing data from 42 tumour bulk revealed increased immune cell abundance and pathways involving regulation of immune cells in tumour samples when compared to normal brain. Complemented by single cell RNA sequencing, our analysis reveals increased immune activity within the tumour core and the invading margin of DIPG tumours. There is limited infiltration of T cells, but high infiltration of tumour associated macrophages (TAMs) specifically bone-marrow derived macrophages and resident microglia in the primary and disseminated locations of the tumour. Using marker discovery algorithms to define TAM specific signatures, we inferred TAM states and found activation states distributed along a scale of M1 (“pro-inflammatory”) to M2 (“oncogenic”) macrophage states. Our results further add to the growing body of evidence that TAMs do not cleanly fit into the dichotomous M1/M2 classification of activation. Our results suggest immune cells in DIPG are lacking inflammation signatures and are promoting an immune suppressed microenvironment thus elucidating a target for therapy. Finally, we identify a cancer-testis antigen that is upregulated in DIPGs and can be exploited as an adoptive T cell immunotherapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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