The role of heritability, priority effects, and climate change in plant microbiomes
Notice bibliographique
Résumé
Microbes and plants shape each other's fitness, meaning we cannot understand or predict the ecology and evolution of plants and microbes without also understanding their interactions. In my thesis, I examine how the patterns and processes that underlie plant-microbe symbioses affect plant performance, with a focus on the role of host genotype (Chapter 2), priority effects (Chapter 3), and abiotic stressors (Chapters 4 and 5) in the community assembly of plant microbiomes.Determining which plant traits matter to microbes is important for understanding how and why plants and microbes interact. I explored the genetic architecture of a vine’s leaf microbial phenotype by comparing the relative importance of quantitative genetic loci and a Mendelian locus of large effect on microbe abundance and heritability (Chapter 2). I found that both types of genetic variation mattered to microbes, with roughly equal magnitudes of effect, but that host age and environment also played a large role. My results suggest there is scope for eco-evolutionary feedbacks between plants and heritable microbes. Given that plants do not always associate with the most beneficial microbes, factors other than partner choice must play a large role in mutualistic symbioses. I investigated the role of historical contingency and priority effects using the legume-rhizobium symbiosis (Chapter 3). The first rhizobium strain to colonize the legume primarily determined plant performance and the root rhizobia community. My results demonstrate that mutualism outcomes can be influenced not just by partner identity, but by partner interaction order, and that priority effects could help lower-quality mutualists persist. Heat and drought alter soil microbiomes, and the persistence of these changes and their subsequent impacts on plant performance and symbiosis are important for predicting plant responses to climate change. I found that mutualistic and parasitic symbiotic soil microbes are affected by heat and drought long after treatment (Chapter 4) and that while drought-treated microbes harm plant performance, the addition of a mutualist erased plant performance differences between climate-treated soil microbiomes (Chapter 5). Strong microbially-mediated indirect effects of climate change may impose additional ecological pressures on plants who must already respond to the direct effects of climate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».