Calexcitin B: a new calcium-sensor protein in the nervous system of the squid
Notice bibliographique
Résumé
Calcium ions (Ca 2+) are paramount for cell viability and function. The Ca 2+ signalling pathways utilize specialized proteins, called Ca 2+ binding proteins (CaBPs). Calexcitin (CE) is a CaBP that putatively acts as an intracellular Ca 2+ -mediated messenger. CE is expressed specifically in the nervous system, and may play a critical role in memory. In this work, I elucidated the correct primary structure of CE and characterized its biochemical and biophysical properties. CE can bind three Ca 2+ at affinities similar to other Ca 2+ -sensor proteins. In addition, I have shown that CE is a member of the sarcoplasmic Ca 2+ binding protein (SCP) subfamily of the EF-hand superfamily. Like other SCPs, CE can bind Mg 2+ and has a complex Ca 2+ /Mg 2+ interplay that affects its structure. My studies have identified the physiological role of Mg 2+ binding and has shown that CE is a two domain protein that exists in three distinct conformational states: Apo-CE, has molten-globule characteristics; Mg 2+ -loaded CE possesses one native domain and the other domain is molten-globule like; Ca 2+ -loaded CE has both domains in native configuration. This indicates that under physiological concentrations of Mg 2+ and Ca 2+, Mg 2+ -CE represents the resting state of the molecule and Ca 2+ -CE is the active state. The backbone nuclei of CE has been assigned by nuclear magnetic resonance and the results show that CE is composed of nine a-helices, eight of which form the four EF-hands and the ninth is near the C-terminus. This result clarified previous discrepancies in the literature regarding the secondary structure of CE and lays the foundation for studying the protein dynamics of CE. Models of CE, based on related proteins, show that, in agreement with biophysical data, CE is composed of two domains that do not interact considerably. Furthermore, in agreement with biophysical data, the model shows a putative recessed hydrophobic pocket that may be involved in target recognition, analogous to other Ca 2+ -sensor proteins. This thesis provides the basis for future investigations into elucidating the precise physiological function of CE. In addition, it enhances our understanding on how CaBPs work and how we can exploit their function for practical neuroprotective applications.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».