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Enregistrement W7132965280

A molecular and genetic analysis of drosophila cadherin DCad87A

2003· dissertation· W7132965280 sur OpenAlexaff
Maretta Chase

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2003
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensBibliographical Society of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantRNA interferenceGeneDrosophila melanogasterGenetic analysisMutationPhenotypeGenetic screen
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

I helped to improve the annotation of the Drosophila cadherin gene, Dcad87A, identified by the BDGP project. I generated polyclonal antibodies against Dcad87A and used these to analyze the protein distribution during embryogenesis and oogenesis. Dcad87A is mainly found in epithelial tissues. Subcellularly, Dcad87A is predominantly located on the apical membrane and in cytoplasmic vesicles. The distribution between the two subcellular pools is dynamically regulated during morphogenetic processes. Further, there is evidence that suggests that in some tissues Dcad87A is associated with microvilli. To gain an understanding of the function of Dcad87A, I employed different strategies to inactivate the gene function of Dcad87A. First, Dcad87A dsRNA was injected into embryos in order to silence Dcad87A. This did not produce a detectable embryonic or 1st instar larval mutant phenotype suggesting that Dcad87A may not be required for embryogenesis. I also designed and participated in the generation of RNA interference foldback constructs that will be used to silence Dcad87A postembryonically. Second, I analyzed lethal mutations that map to the chromosomal position of Dcad87A but found no evidence that one of those represents a mutation in Dcad87A. A sequence comparison revealed that the closest mammalian homologue to Dcad87A is cadherin23. Mutations of cadherin23 cause defects in the stereocilia (modified microvilli) of the hair cells of the inner ear, which leads to congenital deafness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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