MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7132983815

Identification of an ATP-binding cassette cystine import system of Streptococcus mutans and its transcriptional regulation

2008· dissertation· W7132983815 sur OpenAlexafffund
Boram Kim

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2008
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of OttawaLibrary and Archives Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésBiofilmOperonCystineStreptococcus mutansMutantTranscriptional regulationATP-binding cassette transporterTransporterGene expressionGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The polar amino acid ATP-binding cassette (ABC) transporter, CysBPA, was shown to mediate L-cystine uptake in Streptococcus mutans. Transcriptional analysis enabled identification of a tricistronic operon and the transcriptional start site for cysBPA. Phenotypic characterization of the DeltacysBPA mutant showed a 28% decrease in biofilm biomass and formation of sparse, fragile biofilms when compared to wild-type biofilm grown in a semi-defined minimal medium. While assessing cystine transport, the DeltacysBPA mutant was less efficient at L-cystine uptake and its ability to grow was severely impaired under L-cystine starvation conditions. A substrate competition assay showed that L-cystine uptake by CysBPA was strongly inhibited by DL-cystathionine and L-djenkolic acid and moderately inhibited by S-methyl- L-cysteine and L-cysteine. Through gene expression analysis, the cystine transporter was shown to be up-regulated under cystine starvation and in biofilm-grown cells under acidic conditions. In summary, the CysBPA transporter is involved in cystine transport, growth, and biofilm formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTSpace→Même sujetBacterial biofilms and quorum sensing→Travaux en français237 207→