MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7132987369

Uncovering the Mechanisms of how ROS drive NETosis: The Crucial Role of DNA Repair Pathway

2023· dissertation· W7132987369 sur OpenAlexafffund
Dhia Azzouz

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMitacsCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCystic Fibrosis Canada
Mots-clésNeutrophil extracellular trapsProgrammed cell deathApoptosisReactive oxygen speciesDNA damageIonomycinMitochondrion
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neutrophil extracellular traps (NETs) are cytotoxic protein-coated, DNA-based web-like structures implicated in antimicrobial defense, autoimmune diseases and tissue injury. NETotic cell death (NETosis) is defined as a reactive oxygen species (ROS)-dependent cell death, restricted to cells of hematopoietic origin, and associated with NET extrusion. In response to different agonists, neutrophils produce ROS via either NADPH oxidase (NOX-dependent) or mitochondria (NOX-independent) pathways. However, the role of ROS in NETosis was unclear. Additionally, whether NETosis and apoptosis could happen in the same neutrophil was unknown. It was also unknown whether ultraviolet (UV) radiation, a classical inducer of apoptosis and mitochondrial ROS, could induce NETosis. Here, I uncovered that: (i) High UV doses induce both NETosis and apoptosis in the same neutrophil (ApoNETosis); (ii) Base excision repair (BER), the pathway that repairs oxidative DNA damage, is necessary for UV-induced mitochondrial ROS-mediated NETosis. Specifically, inhibiting early, but not late, stages of BER leading to nick formation inhibited UV-induced NETosis; (iii) Unlike in UV-induced NETosis, mitochondrial ROS-induced DNA damage repair and histone citrullination both contribute to calcium ionophore (A23187, ionomycin from Streptomyces conglobatus)-induced NOX-independent NETosis; (iv) In response to bacteria and bacterial components, neutrophils produce large quantities of NOX-derived ROS. Early, but not late, stages of BER were also involved in NETosis induced by Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli lipopolysaccharide, and phorbol 12-myristate 13-acetate; (v) Typically, neutrophils undergo NETosis in serum-free conditions (e.g., lung airways). Baseline NETosis in untreated neutrophils, under normothermic and hyperthermic conditions, is driven by NOX-derived ROS. Under normothermic conditions, early stage BER inhibition abolishes NETosis while late stage BER inhibition promotes it, contrasting agonist-induced NETosis. In mechanistic terms, I identified a novel NETosis agonist, UV, capable of inducing both NETosis and apoptosis (ApoNETosis). We have determined how ROS drives NETosis: through base oxidation, ROS drives NETosis by activating DNA repair machinery, resulting in DNA nicking and chromatin unwinding. This mechanism is consistently observed across all forms of NETosis we investigated. My findings provide new insights into the mechanisms of NETosis, and suggest that some of the DNA repair genes may be relevant to NET-related diseases and candidates for therapeutic studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTSpace→Même sujetNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms→Travaux en français237 207→