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Enregistrement W7132991878

Cloning and characterization of the insulin receptor-related receptor (IRR) reveals that it is closely associated with trkA in the genome and maps to human chromosome 1q22, A type 2 diabetes susceptibility locus

2002· dissertation· W7132991878 sur OpenAlexfundno aff
Susan Rainey

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2002
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBanting and Best Diabetes Centre, University of TorontoBộ Giáo dục và Ðào tạoMinistère de l’Éducation, Gouvernement de l’OntarioUniversity of TorontoScottish Rite Charitable Foundation of Canada
Mots-clésLocus (genetics)GeneGene mappingGenomeHuman genomePositional cloningCandidate geneRegulatory sequenceIntergenic regionGene family
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The insulin receptor-related receptor (IRR) is structurally and functionally related to the insulin receptor and IGF-IR, but its physiological ligand and role are unknown. Cloning of the mouse IRR gene in this study has revealed that the IRR gene is positioned extremely close to the trkA gene in the genome; this genomic orientation is conserved in humans. The IRR and trkA genes are arranged head-to head, with their transcription start only ∼1.6 kb apart. This close proximity raises the interesting possibility that this intergenic region functions as a bidirectional (divergent) promoter, responsible for the temporal and spatial coordinate expression of these genes seen in specific neurons. This observation also supports the possible existence of other members of these receptor tyrosine kinase families, and provides considerations for the development and analysis of knockout mice. Cross-species promoter analysis in this study identifies several well conserved motifs, (including a putative insulin response element (IRE)), supporting their potential involvement in the regulation of gene expression The identification of a polymorphic marker within the first intron of IRR allowed the precise mapping of this gene to human chromosome 1q22, with respect to several known polymorphic markers. This revealed that IRR lies in a region that has been shown to be linked to the development of type 2 diabetes in several populations, indicating that IRR is a candidate gene for the development of this disease. A human genomic clone carrying IRR was identified in the high throughput genome sequencing database, providing the full genomic sequence of IRR, to allow for investigations of polymorphisms within this gene. Other candidate genes, including hypothetical genes, within this chromosomal region have been identified, and a novel mathematical model to help evaluate coding regions of DNA and colon reading frames has been developed. This model has been used as a tool to further investigate hypothetical genes in the IRR chromosomal region, showing that this tool can be applied to further predict the validity and accuracy of these potential coding regions, which are additional candidate genes for the development of type 2 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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