Min-max Driving Force Analysis and In Vitro Enzyme Characterization of Proposed In Vivo Ethylenediamine Production Pathway
Notice bibliographique
Résumé
Ethylenediamine is a large volume chemical used in the synthesis of advanced products across multiple industries and has multiple potential applications in sustainable chemistry. It’s currently produced from petroleum-based processes that raise environmental and health concerns. Here we report on the assessment of the thermodynamic and biochemical feasibility of a proposed enzymatic ethylenediamine bioproduction pathway that would branch from existing engineered ethylene glycol utilization pathway in Escherichia coli. The bioproduction pathway branches from glycolaldehyde, which undergoes a transamination/oxidation step followed by the other before a final transamination step. Min-max Driving Force analysis concluded that the pathway is thermodynamically feasible under certain pathway conditions. Transamination of glycolaldehyde, glyoxal, and aminoacetaldehyde by Silicibacter pomeroyi transaminase SPO3471 were observed and production of monoethanolamine and ethylenediamine were confirmed. Oxidation activity on glycolaldehyde and monoethanolamine by E. coli methylglyoxal reductase ydjG were observed, however production of glyoxal and aminoacetaldehyde could not be directly confirmed due to insufficient evidence and molecular instability respectively. Our results highlight the potential of oxidoreductases and transaminases to be used in an in vivo system for the biosynthesis of ethylenediamine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».