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Enregistrement W7133021897

Spell Checking Nature: Development of a CRISPR- Mediated Gene Editing Approach for the Treatment of Pathogenic Duplications

2020· dissertation· W7133021897 sur OpenAlexafffund
Daria Wojtal

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2020
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesMuscular Dystrophy CanadaHospital for Sick ChildrenDuchenne Research Fund
Mots-clésGene duplicationMuscular dystrophyDystrophinDuchenne muscular dystrophyExonGeneGenome editingTandem exon duplicationCRISPR
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a neuromuscular disorder that leads to progressive muscle deterioration, loss of ambulation, and respiratory complications. It is caused by genetic mutations that result in the absence of dystrophin protein expression needed for muscle function. Despite significant advances in our understanding of the pathogenesis of DMD, no curative treatment has been identified to date and the disorder has a life-limiting disease trajectory. Recently, we have pioneered an approach to successfully remove large duplications in patient cells. We first tested this approach in vitro by removing a multi-exon (18-30) duplication of 139 kb in the DMD gene using Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/CRISPR-associated Nuclease (Cas9) with a single guide. To test our treatment approach in vivo, I first generated a mouse model harboring a multiexon duplication of 136.8 kb in Dmd using CRISPR/Cas9. This first multiexon duplication model of DMD specifically mimics a patient duplication of Exons 18-30. Molecular and functional characterization of this model reveals dystrophin deficiency with characteristic markers of dystrophic muscle. Furthermore, using our previously described CRISPR/Cas9 single guide strategy, we have for the first time treated a large genomic duplication in vivo and shown successful removal of the duplication fragment leading to restoration of full-length dystrophin in skeletal and cardiac muscles. Additionally, histopathological analysis shows that treated mice have less indications of dystrophy including fewer centrally localized nuclei as well as significantly improved muscle function. Our findings establish the far-reaching therapeutic utility of CRISPR/Cas9, which can be tailored to target numerous inherited disorders caused by duplications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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