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Enregistrement W7133026548

Investigating mechanisms of chlorinated ethane biotransformation using compound specific carbon isotope analysis

2007· dissertation· W7133026548 sur OpenAlexfundno aff
Sarah Kathleen Hirschorn

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2007
Typedissertation
Langue
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiotransformationBiodegradationFractionationCometabolismReductive dechlorinationHydrolysisMicrobial biodegradationIsotope fractionationIsotope analysis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stable carbon isotope fractionation during biotransformation of the chlorinated ethanes 1,2-dichloroethane (1,2-DCA), 1,1,1-trichloroethane (1,1,1-TCA) and 1,1-dichloroethane (1,1-DCA) was investigated. Isotopic fractionation during aerobic 1,2-DCA biotransformation in microcosms, enrichment cultures and pure microbial cultures was measured and was found to be pathway dependent. Biodegradation of 1,2-DCA under aerobic conditions produced a consistent bimodal distribution of enrichment factors (s) with one mean c centered on –3.9 ± 0.6‰ and the other on –29.2 ± 1.9‰. Reevaluation of ϵ in terms of kinetic isotope effects 12k/ 13k, gave values of 12k/13k = 1.01 and 1.06, which are typical of oxidation and hydrolytic dehalogenation (S N2) reactions, respectively. The relationship between degradation pathway and measured carbon isotope fractionation was applied to constrain the degradation pathway of 1,2-DCA in a microbial enrichment culture capable of degrading 1,2-DCA under both O2 and NO3-reducing conditions, but where the degradation pathway was previously uncharacterized. δ 13C values indicated biodegradation in the enrichment culture under both O2 and NO3-reducing conditions likely proceeded via a hydrolytic dehalogenase enzyme. Stable carbon isotope analysis during biotransformation of other chlorinated ethanes was then investigated. Isotopic enrichment factors of -1.9‰ and -10.4‰ were measured during reductive dechlorination of 1,1,1-trichloroethane (1,1,1-TCA) and 1,1-dichloroethane (1,1-DCA), respectively. These are the first reported isotopic enrichment factors for microbial biotransformation of these compounds, which can now potentially be applied to investigate and quantify biodegradation of 1,1,1-TCA and 1,1-DCA in the field. Stable carbon isotope analysis was used to provide a conservative estimate of the extent of 1,2-DCA and trichloroethene (TCE) biodegradation in a biostimulation field study. Isotope analysis was able to confirm that 1,2-DCA degradation, rather than degradation of vinyl chloride, was the primary mechanism of ethene production at the site. This thesis not only advances the application of compound specific carbon isotope fractionation to identify and quantify biodegradation of chlorinated ethanes in groundwater, but in particular progresses our understanding of the relationship between the enzymatic mechanisms of contaminant degradation and isotopic fractionation, and the ability to use that knowledge to predict degradation mechanisms for previously unconstrained pathways of contaminant remediation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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