Characterization of PIDD, a death domain-containing p53 target gene
Notice bibliographique
Résumé
The p53 tumour suppressor promotes cell cycle arrest or apoptosis in response to diverse stress stimuli. p53-mediated cell death depends in large part on transcriptional upregulation of target genes. One of these targets, p53-induced protein with a death domain (PIDD), was shown to function as a mediator of p53-dependent apoptosis. Previous work in our lab demonstrated that antisense inhibition of PIDD expression attenuated p53-mediated apoptosis suggesting that PIDD expression is required for apoptosis. The work presented here is a characterization of the protein and the apoptotic pathways involved downstream of PIDD. Here we describe the generation and validation of a PIDD polyclonal antibody, and demonstrate its usefulness for Western blotting, immunoprecipitation and immunofluorescence (IF) analysis. These studies demonstrate that PIDD is a cytoplasmic protein and that PIDD is upregulated by p53 activation and in response to DNA damage. In addition, we show that PIDD-induced death and growth suppression in embryonic fibroblasts are dependent on the adaptor protein RAIDD (receptor-interacting protein (RIP)-associated ICH-1/CED-3 homologous protein with a death domain). We also provide evidence that PIDD-induced cell death is associated with the early activation of caspase-2, and later activation of caspase-3 and caspase-7. Our results also show that caspase-2-/- MEFs in contrast to RAIDD-/- MEFs are only partially resistant to PIDD. These findings suggest that caspase-2 contributes to PIDD-mediated cell death but that it is not the sole effector of this pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».