Notice bibliographique
Résumé
Sex is predicted to be a costly mode of reproduction associated with drawbacks such as a genetic transmission disadvantage, the destruction of favourable genetic associations, and the cost of finding mates. Despite this, most eukaryotic species reproduce sexually at least occasionally. In my thesis I use genomics and field work to explore the possible benefits and consequences of sexual reproduction. In Chapter 2, I analysed data from a mutation accumulation experiment using two highly asexual duckweed species. My analyses revealed some of the lowest known multicellular eukaryotic mutation rates, possibly a consequence of asexuality. In Chapter 3, I analysed patterns of linkage disequilibria (LD) in two population genomics datasets to explore the potential role of negative LD and synergistic epistasis among deleterious mutations in favouring sex. I found that patterns of genome-wide LD among deleterious mutations differed from those of neutral mutations, but that this was likely a by-product of complex demographic processes. Further analyses focusing specifically on deleterious mutations affecting genes in established genetic networks did suggest a signal of within-network negative LD, hinting at a possible role of negative epistasis in favoring the evolution of sex. In Chapter 4, I used exploratory population genomics analyses to examine signatures of selection and recombination in the facultatively sexual liverwort Marchantia polymorpha. My findings suggested that despite the likely limited dispersal of bryophyte sperm, M. polymorpha populations appear to engage in sexual reproduction at least occasionally. However, other analyses suggested that the M. polymorpha genome harbors a large fraction of deleterious genetic diversity, a possible hint of inefficient selection associated with predominantly asexual reproduction. Finally in Chapter 5, I attempted to experimentally compare the fitness of sexual and asexual offspring in M. polymorpha in a field experiment to broadly ask which mechanisms may favour the evolution of sex. However, my analyses suggested that almost all variation in fitness in my experiment was due to environmental heterogeneity, precluding any biologically meaningful comparisons of sexual and asexual offspring. Overall, my thesis contributes to our understanding of the consequences of sexual and asexual reproduction, particularly in species where both reproductive modes are employed.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».