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Enregistrement W7133034841

Role of Microornas in Tumroigenesis and their Modulation by Versican 3' Untranslated Region

2010· dissertation· en· W7133034841 sur OpenAlexfundno aff
Daniel Yen-Hong Lee

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of ChinaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésVersicanmicroRNAThree prime untranslated regionUntranslated regionGene expressionRegulation of gene expressionCarcinogenesisRegulator
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNA is a single-stranded RNA molecule of about 22 nucleotides in length and is expressed endogenously. It functions as a gene regulator by pairing imperfectly with 3’ untranslated region (3’UTR) of target mRNAs, leading to translational inhibition. MicroRNA is implicated in many regulatory pathways and hence affects various cellular activities. In the development of cancer, genetic alterations occurred at miRNA locus and its expression level is dysregulated in various cancers versus normal tissue counterparts. It is thus important to find the targets of dysregulated microRNAs contributing to progression of cancer. To facilitate long term functional studies, a microRNA expression construct with unique futures was generated. Stable expression of miR-378 enhanced cell survival, reduced caspase-3 activity, and promoted tumor growth and angiogenesis. By algorithmic predictions and proteomic analysis, two tumor suppressors, SuFu and Fus-1, were found to be translationally regulated by miR-378. Target validation was confirmed by co-transfection experiments and luciferase activity assays, reassuring its oncogenic role by regulating two tumor suppressor genes simultaneously. Conversely, microRNA can also function as a tumor suppressor by modulating expression of Versican, an extracellular matrix protein known to facilitate tumorigenesis and angiogenesis. By a novel PCR method, more than one microRNA were found to bind to Versican 3’UTR. iii Among these microRNAs, targeting of Versican and Fibronectin by miR199a-3p was validated. Expression of a fragment of Versican 3’UTR was expected to antagonize the function of miR-199a-3p. Stable expression of Versican 3’UTR resulted change in cell morphology and increased cell-cell adhesion. Analysis of primary tissues from transgenic mice expressing versican 3’UTR showed an increase expression of Versican and Fibronectin, and organ adhesion was found between liver and its surrounding tissues. In addition, 3’UTR also modulated the level of miR-199a-3p and miR-136, alleviating translation of negative cell cycle regulators, PTEN and Rb1. This resulted in reduced cell proliferation and hence diminished tumor growth. These findings suggest a role of microRNA in tumor growth, providing a valuable target for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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