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Enregistrement W7133051259

Integrative Genomics of Human Cerebellar Development and Group 3/4 Medulloblastoma

2023· dissertation· W7133051259 sur OpenAlexaff
Liam Doherty Hendrikse

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaSonic hedgehogWnt signaling pathwayProgenitor cellProgenitorHindbrainSomatic cellCellular differentiationSubventricular zone
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB) comprises a group of heterogeneous pediatric neuronal neoplasms of the hindbrain with strong links to early development of the hindbrain. While Sonic Hedgehog MB arises in the upper rhombic lip (RL) granule cell lineage due to mutations that activate Shh signaling, and WNT MB arises in the lower RL due to mutations activating WNT signaling, little is known about the more common Group 4 (G4) MB, thought to arise in the unipolar brush cell (UBC) lineage. We demonstrate that somatic mutations in G4 MB converge on the Core Binding Factor Alpha (CBFA) complex, observing mutually exclusive alterations affecting CBFA2T2, CBFA2T3, PRDM6, KDM6A, and OTX2. CBFA2T2 is expressed early in the progenitor cells of the Homo sapiens cerebellar RL subventricular zone (RLSVZ), and G4 MB transcriptionally resemble these RLSVZ progenitors but are stalled in developmental time. Knockdown of OTX2 in model systems relieves this differentiation blockade, allowing MB cells to spontaneously proceed along normal developmental differentiation trajectories. The unique nature of the split human RL, destined to generate the majority of the neurons in the human brain, with its high level of susceptible EOMES+ KI67+ UBC progenitor cells, likely predisposes our species to the development of G4 MB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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