Integrative Genomics of Human Cerebellar Development and Group 3/4 Medulloblastoma
Notice bibliographique
Résumé
Medulloblastoma (MB) comprises a group of heterogeneous pediatric neuronal neoplasms of the hindbrain with strong links to early development of the hindbrain. While Sonic Hedgehog MB arises in the upper rhombic lip (RL) granule cell lineage due to mutations that activate Shh signaling, and WNT MB arises in the lower RL due to mutations activating WNT signaling, little is known about the more common Group 4 (G4) MB, thought to arise in the unipolar brush cell (UBC) lineage. We demonstrate that somatic mutations in G4 MB converge on the Core Binding Factor Alpha (CBFA) complex, observing mutually exclusive alterations affecting CBFA2T2, CBFA2T3, PRDM6, KDM6A, and OTX2. CBFA2T2 is expressed early in the progenitor cells of the Homo sapiens cerebellar RL subventricular zone (RLSVZ), and G4 MB transcriptionally resemble these RLSVZ progenitors but are stalled in developmental time. Knockdown of OTX2 in model systems relieves this differentiation blockade, allowing MB cells to spontaneously proceed along normal developmental differentiation trajectories. The unique nature of the split human RL, destined to generate the majority of the neurons in the human brain, with its high level of susceptible EOMES+ KI67+ UBC progenitor cells, likely predisposes our species to the development of G4 MB.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».