Customized Approaches for Inhibition and Degradation of Drug Targets
Notice bibliographique
Résumé
Diseases are often caused by increase or decrease of specific proteins, and changes in the level of their activities in cell. Many cancers have already been directly or indirectly linked to such changes, for example. This necessitates development of therapeutics for diseases caused by such imbalances and dysregulations. Therefore, the dysregulated proteins are attractive drug targets, and small molecules are needed to modulate their function or antagonize their interactions with partner proteins. However, some protein targets may not be druggable, and finding small molecule modulators of their function may not be practical. Alternative approach would be to selectively target these proteins for degradation. This approach utilizes protein degradation pathway to specifically ubiquitinate the protein of interest by E3 ligases and mark it for degradation. My research takes advantage of all available options for modulating the level of activities of drug targets. Major step in the discovery of small molecule modulators of drug targets is to characterize their function and develop high throughput methods for screening. In the first chapter of my thesis, I focused on better understanding of the mechanism of function of protein arginine methyltransferase (PRMT) 1 in nucleosome setting by investigating its crosstalk with other methyltransferases. This study resulted in discovery of the activating effect of monomethylation of H4K20 on nucleosome by SETD8 on H4R3 methylation by PRMT1. In the second chapter, I focused on discovery of ligands for DDB1 Cul4-associated factor 1 (DCAF1) to employ the protein degradation approach. This project resulted in discovery of a potent antagonist of DCAF1 with a Kd value of 38 nM, a great step in the development for a chemical probe or PROTAC. Utilizing the two different approaches in targeting proteins of interest, will result in new opportunities that can facilitate early-stage drug discovery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».